Ο Κωνσταντίνος Αναγνωστόπουλος είναι πτυχιούχος του Τμήματος Χημείας του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης και Διδάκτορας του Εργαστηρίου Βιοχημείας του ίδιου τμήματος.

Εργάστηκε ως μεταδιδάκτορας (με υποτροφία της Max-Planck Gesellschaft zur Foerderung der Wissenschaft και στη συνέχεια της Ευρωπαϊκής Ένωσης, με το πρόγραμμα Training and Mobility of Researchers) στον προσδιoρισμό της δομής των ριβοσωμάτων στο Arbeitgruppe Ribosomen του Max-Planck Insitut fuer Molekulare Genetik στο Βερολίνο υπό τη διεύθυνση της Ada Yonath, η οποία τιμήθηκε με το βραβείο Nobel Χημείας το 2009. Εργάστηκε ως Βιοχημικός στο Νοσοκομείο «Παπαγεωργίου» στη Θεσσαλονίκη. Το 2004 διορίστηκε ως Λέκτορας στο Εργαστήριο Βιοχημείας του Τμήματος Ιατρικής του Δημοκριτείου Πανεπιστημίου Θράκης στο οποίο είναι τώρα Αναπληρωτής Καθηγητής.